如果你的mysql版本是5.6以后的版本，那么默认的存储引擎就是InnoDB，5.6以后InnoDB的性能已经优化的很好了，MylSAM基本可以放弃了。
如果是5.6之前的版本可以考虑@vus520的答案，因为MylSAM是不支持外键和事务操作的，只适合简单表关系。 InnoDB基本支持所有的情况。

查多 MylSAM
写多 InnoDB
事务严格 InnoDB

实际项目中，我们都迁到了InnoDB上

网上搜的，可以参考下， http://www.cnblogs.com/villion/archive/2009/07/09/1893762.html